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創(chuàng)建時(shí)間:2017-07-26當(dāng)前位置: 首頁 >> 行業(yè)動(dòng)態(tài) >> 展會(huì)動(dòng)態(tài)

基因測序攜大數(shù)據(jù)打通上下游

7月14日,深圳華大基因股份有限公司在深交所創(chuàng)業(yè)板正式上市交易,募集資金總額為5.47億元,發(fā)行價(jià)格為13.64元/股,成為深交所第2001家上市公司。作為國內(nèi)最大的高通量基因測序服務(wù)和設(shè)備提供商,龍頭企業(yè)上市對(duì)基因測序領(lǐng)域的成長拉動(dòng)效應(yīng)十分明顯。

  新技術(shù)和新需求讓基因測序、精準(zhǔn)醫(yī)療以及相關(guān)設(shè)備器械領(lǐng)域逐步實(shí)現(xiàn)從技術(shù)端口向健康管理平臺(tái)的角色轉(zhuǎn)變。圍繞生命醫(yī)療大數(shù)據(jù),產(chǎn)業(yè)鏈上中下游都在回歸健康管理、臨床診療本質(zhì),數(shù)據(jù)與商業(yè)邏輯深度結(jié)合,促使傳統(tǒng)基因測序和相關(guān)器械設(shè)備領(lǐng)域加速融入醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)鏈。

  數(shù)據(jù)融入臨床需求

  近年來,全球基因組學(xué)應(yīng)用行業(yè)不斷實(shí)現(xiàn)技術(shù)突破,行業(yè)發(fā)展勢頭良好,科研、醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)和普通民眾對(duì)基因測序的接受程度越來越高。據(jù)BCCResearch預(yù)計(jì),基因測序行業(yè)將保持快速增長勢頭,2020年市場規(guī)模將達(dá)138億美元,年復(fù)合增長率為18.7%。

  由于基因科技的大規(guī)模應(yīng)用必須建立在大量基因數(shù)據(jù)的積累和解讀基礎(chǔ)之上,所以基因測序產(chǎn)品和生物信息分析是基因檢測細(xì)分市場的瓶頸和核心,其中的數(shù)據(jù)解讀與服務(wù)是整個(gè)行業(yè)最有價(jià)值的部分,體現(xiàn)了基因公司的研發(fā)實(shí)力,擁有先進(jìn)技術(shù)和能力的企業(yè)便具備了生命健康產(chǎn)業(yè)的核心競爭力。

  在近日于深圳舉行的“第二屆基因組云計(jì)算技術(shù)開發(fā)者大會(huì)”上,北京榮之聯(lián)科技股份有限公司董事長王東輝稱,基于基因檢測和精準(zhǔn)醫(yī)療產(chǎn)生的大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè),未來發(fā)展方向主要包括為B端用戶提供數(shù)據(jù)服務(wù)和為C端用戶提供健康管理?!邦嵏矀鹘y(tǒng)信息分析以計(jì)算為中心的技術(shù)架構(gòu),轉(zhuǎn)變?yōu)椤陨鼣?shù)據(jù)’為中心;在醫(yī)療數(shù)字化方面,圍繞醫(yī)學(xué)智能輔助診斷、影像三維可視化系統(tǒng),將疾病治療從依賴二維經(jīng)驗(yàn)轉(zhuǎn)變?yōu)槿S、可量化的數(shù)字體系,顯著提高診斷精準(zhǔn)性?!?br/>
  從學(xué)術(shù)突破到工具國產(chǎn)化,中國基因測序器械設(shè)備產(chǎn)品和檢測臨床服務(wù)正在逐步融入醫(yī)藥核心產(chǎn)業(yè)鏈條。藥明康德集團(tuán)企業(yè)明碼生物首席技術(shù)官、中國區(qū)負(fù)責(zé)人孫洪業(yè)博士表示,基因數(shù)據(jù)只有交換才能創(chuàng)造價(jià)值,而分析計(jì)算和共享的基礎(chǔ)是標(biāo)準(zhǔn),只有依靠標(biāo)準(zhǔn)化的計(jì)算能力和分析產(chǎn)品才能支持臨床大型隊(duì)列研究和藥物研發(fā)轉(zhuǎn)化,從輸入、過程、結(jié)果三個(gè)環(huán)節(jié)提供完善流程和可視化分析。

  以一個(gè)美國CLIA認(rèn)證實(shí)驗(yàn)室的病人為例,其樣本中獲取的臨床級(jí)別測序數(shù)據(jù),參照已有病人的測序數(shù)據(jù),利用基因組注釋和臨床序列分析工具,通過數(shù)據(jù)拼接和變異尋找,比對(duì)全基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行深度分析低頻變異,測序與解讀均具有不可替代的重要性和唯一性。顯然,從感染性疾病,到基因性出生缺陷和惡性腫瘤,從精準(zhǔn)診斷、治療到康復(fù),基因測序及相關(guān)器械設(shè)備產(chǎn)品將更全面地提供精準(zhǔn)的檢測、完善的解決方案和有競爭力的價(jià)格,滿足未被滿足的臨床需求。

  橫向資源協(xié)調(diào)合作

  創(chuàng)新制造以智能化為典型特征,要求中國醫(yī)藥企業(yè)以新技術(shù)提升運(yùn)營效率。精準(zhǔn)醫(yī)療是未來醫(yī)療行業(yè)的發(fā)展趨勢,而精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展必須依托大數(shù)據(jù)平臺(tái),因?yàn)槠脚_(tái)運(yùn)營與數(shù)據(jù)服務(wù)是生物醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要環(huán)節(jié),基礎(chǔ)設(shè)施供應(yīng)商合作并采用聯(lián)合運(yùn)營的方式,才能為醫(yī)療機(jī)構(gòu)、測序企業(yè)等數(shù)據(jù)提供方企業(yè)提供產(chǎn)業(yè)支持保障。

  值得關(guān)注的是,從生命大數(shù)據(jù)提供方企業(yè)的角度,包括華大基因、諾禾致源、金域檢驗(yàn)、藥明康德、達(dá)安基因等,數(shù)據(jù)都需要“存、管、算、察”的強(qiáng)大核心功能支撐,以實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)空間分布式存儲(chǔ)應(yīng)用,解決存儲(chǔ)空間和數(shù)據(jù)持久化、數(shù)據(jù)解耦、分級(jí)部署、數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)、動(dòng)態(tài)重組、信息分析調(diào)度、跨集群分布式計(jì)算等復(fù)雜性問題。

  隨著人類基因組測序成本以“超摩爾定律”速度下降,與之相匹配的基因組數(shù)據(jù)分析成本也在下降,尤其是在2016年至今,短短一年,基因數(shù)據(jù)分析成本的下降速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過了基因測序成本下降的速度?,F(xiàn)在,單個(gè)人的全基因組數(shù)據(jù)分析成本已經(jīng)降低至100元人民幣以內(nèi)。

  基因大數(shù)據(jù)分析包括十幾個(gè)步驟,如果每個(gè)企業(yè)做數(shù)據(jù)分析面對(duì)不同的步驟選擇差異化方法,如何來組織不同的工具更優(yōu)地高效分配計(jì)算任務(wù),這是目前整個(gè)基因測序、云計(jì)算、器械設(shè)備研發(fā)等軟硬件企業(yè)都在致力于優(yōu)化的戰(zhàn)略性工作。北京聚道科技(GeneDock)有限公司CEO李夏戎指出,不僅需要每個(gè)企業(yè)聚焦自身的底層數(shù)據(jù)優(yōu)化,還需要產(chǎn)業(yè)鏈橫向跨步驟協(xié)同。“包括GATK算法優(yōu)化,加速計(jì)算運(yùn)轉(zhuǎn)過程,減少CPU開銷,并且同產(chǎn)業(yè)鏈合作伙伴一同將技術(shù)封裝,制定數(shù)據(jù)壓縮、存儲(chǔ)方案;基因測序公司也需要將數(shù)據(jù)調(diào)整成分布式,從而協(xié)同開發(fā)更加易用的操作流程?!?br/>
  華大基因CEO尹燁表示,檢測成本下降,如今已不是單個(gè)公司憑技術(shù)挖掘就可以解決的,“從上游醫(yī)療器械設(shè)備廠商,到中游基因測序企業(yè),再到下游健康服務(wù)平臺(tái),基因檢測產(chǎn)業(yè)基于生命大數(shù)據(jù)各環(huán)必須共有、共為、共享;全行業(yè)預(yù)計(jì)到2020年能夠?qū)蝹€(gè)人的全基因組測序和分析總費(fèi)用控制在2000元人民幣以內(nèi),數(shù)據(jù)分析流程標(biāo)準(zhǔn)化和費(fèi)用快速下降,將有望提前實(shí)現(xiàn)行業(yè)預(yù)期。”(來源:醫(yī)藥網(wǎng))

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